fungi_diagnostic_chars_comparison_japanese 大菌輪「識別形質まとめ」データセット 最終更新日：2023/6/3（R3-10622まで） ====

Languages

Japanese

This dataset is available in Japanese only.

概要

Atsushi Nakajima（中島淳志）が個人で運営しているWebサイト 大菌輪 では、数千件以上の菌類分類学論文を「論文3行まとめ」という形で要約および索引付け（インデキシング）した情報を提供しています。 その一環として、ある菌と別の菌の「共通する」あるいは「異なる」識別形質 (diagnostic characters) に関する記述を人手で抽出しています。 本データセットは、抽出された識別形質の一覧に、「色/color」、「形状/shape」などのカテゴリを半自動的に付与して集積したものです。 「論文3行まとめ」は毎日更新していますが、本データセットの更新はおおむね1ヶ月に一度とする予定です。

関連データセット

「論文3行まとめ」 Atsushi/fungi_indexed_mycological_papers_japanese 「Trait Circusデータセット」（統制形質） Atsushi/fungi_trait_circus_database

各カラムの説明

• R3ID … 大菌輪「論文3行まとめ」のIDです。
• No … 各識別文を一意のIDで区別するために、各R3IDにおいてナンバリングしたものです。
• comparison_source … 比較元の分類群（学名）です。
• comparison_target … 比較先の分類群（学名）です。
• sentence … 識別文です。全て日本語です。
• label …半自動的に付与されたカテゴリです（人手で修正していますが、ダブルチェックは行っていないので誤分類もあると思います）。以下の25のカテゴリが存在します。
  • サイズ/size
  • 分子系統解析/molecular_phylogenetic_analysis
  • 形状/shape
  • 色/color
  • 地理的分布/geographical_distribution
  • 生息環境/habitat
  • 表面性状/surface_characteristics
  • 構造/structure
  • 有無/presence
  • 形態全般/general_morphology
  • 位置/position
  • 二次代謝産物/secondary_metabolite
  • 呈色反応/chemical_reaction
  • 数量/amount
  • 発達/development
  • 生理学的形質/physiological_characters
  • 分類/classification
  • 資化・発酵能/assimilation_and_fermentation
  • 質感/texture
  • 味・臭い/taste_and_smell
  • 病害・病原性関連/disease_and_pathogenecity
  • 全般/general_characters
  • 耐性・感受性/resistance_and_susceptibility
  • 栄養摂取様式/nutrition_style
  • 未分類/unclassified
• common_or_different … 共通する形質は「1」、異なる形質は「0」です。
• data_source … 各情報の 出典（文献）のURLです。